【摘 要】
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割手密抗逆基因资源的挖掘是甘蔗抗逆育种的重要工作任务.本研究以前期转录组测序得到的割手密REMO基因cDNA序列为探针,对GenBank中的EST数据库进行同源检索,发现高粱REMO基
【机 构】
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云南省甘蔗遗传改良重点实验室,开远,661699;中国热带农业科学院湛江实验站,湛江,524013;广东省旱作节水农业工程技术研究中心,湛江,524013
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割手密抗逆基因资源的挖掘是甘蔗抗逆育种的重要工作任务.本研究以前期转录组测序得到的割手密REMO基因cDNA序列为探针,对GenBank中的EST数据库进行同源检索,发现高粱REMO基因(XM_002465954.1)与其具有极高的相似性(94％).利用高粱REMO基因(XM_002465954.1)设计同源引物,后经PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了7个割手密REMO基因cDNA序列(SsREMO-1a,SsREMO-1b,SsREMO-1c,SsREMO-1d,SsREMO-1e,SsREMO-1f,SsREMO-1,GenBank登录号为MF095088-MF095094.7条序列全长均为738 bp,5'非翻译区(UTR)长度78 bp,3'UTR长度为96 bp,包含一个564bp的开放读码框,编码187个氨基酸.分析表明此蛋白序列具有REMO保守结构域.SsREMO-1 a、SsREMO-1b、SsREMO-1c、SsREMO-1d、SsREMO-1e、SsREMO-1f、SsREMO-1g的相似性在98.9％～99.7％之间,存在14个单核苷酸多态性(SNP)位点,4个氨基酸变异位点,蛋白相似性在98.4％～100％之间.SsREMO-1蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种具有较高的同源性,可分为两个亚类.
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