【摘 要】
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目的建立基因芯片数据处理的标准化方法,研制一套实用、可操作性强的软件Gene_Norm.方法采用criteria将杂交点分为good和bad两类.同时,在bad 杂交点中寻找turn-on-off点.最后
【机 构】
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第三军医大学预防医学系卫生统计学教研室,香港城市大学基因组科技应用研究中心,西南政法大学刑侦学院电子技术教研室
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目的建立基因芯片数据处理的标准化方法,研制一套实用、可操作性强的软件Gene_Norm.方法采用criteria将杂交点分为good和bad两类.同时,在bad 杂交点中寻找turn-on-off点.最后,用平均ratio进行标准化处理.结果将软件Gene_Norm应用于高密度芯片数据的处理,该芯片有10 080个杂交点,每个杂交点有42个记录进行处理,得到了较好的处理结果.讨论本软件适用于大型数据文件的处理,且提供了许多参数以供选择,因此适用性和可操作性强.
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