广西北部湾石角红树林根际红酵母的筛选鉴定,基因组分析及细胞组成测定

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cwg8872757
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对广西北部湾石角红树林根际微生物群落中的红酵母进行筛选、分离和鉴定,得到3株红酵母菌株(B1, B5, B6),通过真菌核糖体基因转录间隔区(internal transcribed spacer, ITS)测序比对和系统发育分析,并结合菌落形态,判定3株筛选得到的红酵母均属于胶红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)。使用Illumina Novaseq测序平台对菌株B1基因组进行测序分析,对得到的全基因组序列进行基因注释,并构建全基因组图谱。同时,利用antiSMASH注释和分析了胶红酵母基因组中次生代谢产物生物合成基因簇之间的差异。对胶红酵母菌株B1的细胞组分进行了分析,结果显示其含有多种脂肪酸,其中油酸含量最高,占总脂肪酸的52.00%,检测到16种氨基酸,谷氨酸含量大,占总氨基酸的17.49%,同时含有β-胡萝卜素和1种未鉴定色素。
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