产EPA海洋细菌Shewanella baltica 6-42全基因组测序及比较基因组分析

来源 :中国油料作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：john0620

【摘要】

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新近发现来源于北极的海洋细菌Shewanella baltica 6-42在低温条件下合成超长链多不饱和脂肪酸二十碳五烯酸（eicosapentaenoic acid C20∶5,EPA）。为了进一步探讨EPA合成调控机

【作者】

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肖康彭云峰罗玲彭方万霞

【机构】

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中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室,油料油脂加工技术国家地方联合工程实验室,油料脂质化学与营养湖北省重点实验室,武汉大学、生命科学学院、中国典型培养物保藏中心

【出处】

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中国油料作物学报

【发表日期】

：

2017年3期

【关键词】

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Shewanella baltica 二十碳五烯酸第三代全基因组测序聚酮合酶途径

【基金项目】

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中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2013-OCRI);十三五重点研发计划(2016YFD0501209-01)

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新近发现来源于北极的海洋细菌Shewanella baltica 6-42在低温条件下合成超长链多不饱和脂肪酸二十碳五烯酸（eicosapentaenoic acid C20∶5,EPA）。为了进一步探讨EPA合成调控机理,本研究通过第三代高通量测序技术对S.baltica 6-42菌株进行全基因组测序,得到高质量且无间断的总长度为5.15 Mb的全基因组序列信息。分析表明全基因组的GC含量为46.17%,预测编码基因有4 597个,共有2 577个基因具有明确的生物学功能,其中348个基因参与环境适应性

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