1.各有效成分的化学稳定性 酸碱性会影响有效成分的稳定，常见的有机磷酸酯、氨基甲酸酯、拟除虫菊酯类杀虫剂，有效成分都是“酯”，一般对碱性比较敏感，会在碱性介质中水解。福美双、代森环等二硫代氨基甲酸类杀菌剂，有效成分在碱性介质中会发生复杂的化学变化而被破坏。有的农药品种虽然在弱碱性条件下相对稳定，但配成弱碱性药液后也要马上用掉，不宜放置过久。因此，与碱性药物的混用一定要慎重。常见的碱性化肥如氨水、碳酸氢铵、沉淀磷酸钙等。有的农药有效成分在酸性条件下会分解或者降低药效。如2，4-d钠盐、二甲四氯钠盐、双甲脒等。常见的酸性药剂有硫酸铜、硫酸烟碱、抗菌剂401、乙烯利水剂等。不少有机磷酸酯农药也带酸性，如水胺硫磷、敌敌畏等。高效氯氰菊酯、高效氯氟氰菊酯（功夫菊酯）等立方体构型较单一的有效成分只在很窄的pH范围内稳定，介质偏酸性易分解，介质偏碱性则会“转位”而降低药效。除酸碱性外，很多农药品种不能与含金属离子的药物混用。二硫代氨基甲酸盐类杀菌剂、2，4-D盐类除草剂与铜制剂混用可与铜离子络合而失去活性。除去铜制剂，其他含重金属离子的制剂如铁、锌、锰、镍等制剂，混用时也要特别慎重。
　　2.保证药液良好的物理性状 乳油制剂对水后应有良好的乳化性能。两种乳油混用的药液，也要求有良好的乳化性能，不能出现乳化不良甚至出现分层、浮油、沉淀等现象。可湿性粉剂混用的药液，也要求有良好的悬浮性能，不能再现絮结、沉淀等现象。凡是混配后药液物理性状明显恶化的都不能混用，以免减效、失效甚至造成药害。农药乳油或可湿性粉剂加工生产时，只是考虑该制剂对水配成物理性状良好的药液，不能做到该制剂与任何其他制剂混用后药液物理性状一定好。
　　3.保证避免出现药害等副作用 有效成分的化学变化可能产生有药害的物质，石硫合剂与波尔多液混用产生有害的硫化铜，也增加了造成的可溶性铜离子。前面叙述的二硫代氨基甲酸类杀菌剂无论在碱性介质中或与铜制剂混用都会产生有害的物质。如果混用造成药液物理性状恶化，如乳状破乳、出现浮油，必定会造成药害。敌稗用于稻田防除稗草，因水稻植株中有一种酰胺酶可以分解敌稗有效成分而解毒。而有机磷、氨基甲酸酯类农药会抑制水稻中的这种酶，它们与敌稗不但不能混用，前后10天内也不能连用，否则会造成药害，与敌稗同属酰胺类的丁草胺等除草剂品种，也存在这个问题。