【摘 要】
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公共数据库中蛋白编码基因错误注释问题影响了数据库的使用质量.通过综合运用多种计算方法对在生物能源及环境治理中具有重要应用的Shewanella oneidensis MR-1菌基因组蛋白
【机 构】
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德州学院山东省生物物理重点实验室,德州学院物理与电子信息学院,山东师范大学生命科学学院
【基金项目】
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国家自然科学基金（61302186）
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公共数据库中蛋白编码基因错误注释问题影响了数据库的使用质量.通过综合运用多种计算方法对在生物能源及环境治理中具有重要应用的Shewanella oneidensis MR-1菌基因组蛋白编码基因进行了重注释,结果得到2个过注释基因,并发现了289个新基因.基于功能已知的蛋白质编码基因表明所采用的过注释算法得到的Ac、MCC、AUC分别为99.90%、0.9982和0.9999.基于BLAST和COG对预测得到的289个欠注释基因进行功能预测表明有152个欠注释蛋白质编码基因得到明确的生物学功能,为今后的深
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