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目的：考察红花的种内变异，为进一步进行红花种质资源选育和筛选品质相关基因奠定基础．方法：采用扩增片段长度多态性（AFLP）技术，研究中国红花28个不同栽培居群在DNA水平的多态性．采用UPGMA构建系统树图进行聚类分析和计算遗传距离．结果：筛选得到的12对引物的扩增片段具有丰富的多态性．各居群间的遗传相似系数在0．48～0．96．聚类分析显示它们分为3大主要类群和一个中间类群．结论：红花种内存在一定的遗传多样性．基于AFLP条带统计的聚类结果和表型特征并不完全一致，可能是基因型和环境共同作用于表型的结果．