【摘 要】
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目的:通过生物信息学方法探究预测乳头状肾细胞癌(KIRP)患者预后相关基因和新免疫治疗靶点.方法:从癌症基因组图谱数据库下载了 KIRP患者的转录组数据和临床数据.利用R语言的
【机 构】
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黄梅县人民医院泌尿外科 湖北 黄冈 435500;武汉大学中南医院泌尿外科 湖北 武汉 430071
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目的:通过生物信息学方法探究预测乳头状肾细胞癌(KIRP)患者预后相关基因和新免疫治疗靶点.方法:从癌症基因组图谱数据库下载了 KIRP患者的转录组数据和临床数据.利用R语言的“limma”软件包,筛选出在乳头状肾细胞癌组织和癌旁组织中表达具有差异性的基因,与来自免疫学数据库(ImmPort)的2 498个免疫相关基因取交集,再使用单因素Cox和多因素Cox分析,构筑免疫相关基因的预后风险模型.结果:构建出由9个免疫相关基因组成的预后风险模型,绘制风险模型的生存曲线和ROC曲线,并研究其与KIRP患者临床病理特征的关系.KEGG富集分析结果表明,我们构建的风险模型与免疫途径密切相关.在TIMER数据库里面验证了模型内基因与肿瘤免疫浸润细胞间的相关性.结论:本研究确定了 9个免疫相关的基因是KIRP患者的有价值的预后指标,这些基因可用于预测KIRP患者的预后结果,并帮助寻找新的免疫治疗思路和靶点.
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