番茄组蛋白去乙酰化酶HD2家族生物信息学及表达模式分析

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在生物信息学分析和克隆番茄组蛋白去乙酰化酶HD2亚家族的基础上,探究了HD2家族在番茄果实发育阶段的表达模式.结果显示,番茄HD2家族有3个成员,其氨基酸序N端具有典型的MEFWG五肽基序,中部为疏水结构域分隔开的两段富含酸性氨基酸的结构域,C端的序列呈多样性,并且具有C2H2型锌指结构;亚细胞定位预测发现该家族成员均定位于细胞核,这与其参与组蛋白修饰功能相一致.表达模式结果显示,HD2基因家族在果实发育阶段中具有阶段特异性,推测其在调控番茄的果实发育方面有重要作用.
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