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以蛹虫草（Cordyceps militaris）4号和8号菌株作为亲本，采用灭活原生质体融合技术获得228个再生菌株。酯酶同工酶与ISSR—PCR方法相结合鉴定融合子，以虫草素含量和子实体性状为筛选指标，经过初步的遗传稳定性测试，得到虫草素含量显著提高的5个稳定融合子——CM59、CM61、CM69、CMl36和CMl86，其虫草素含量分别为8号菌株的1．17～1．73倍。实验证明融合子菌丝中虫草素含量普遍提高。筛选得到的5个融合子经进一步遗传稳定性验证后可用于以获得虫草素为目的的菌丝体发酵培养。