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从复杂适应系统的角度来看，水资源的优化配置正是水资源系统不同层次上的主体不断学习、适应和协调的结果。因此，研究不同层次上主体的学习进化模式对于实现水资源的优化配置具有重要的意义。应用复杂适应系统理论的基本思想研究水资源优化配置问题，在建立的水资源多Agent系统概念的基础上，建立了基于遗传算法的水资源优化配置的3层演化模型，并以南水北调东线工程水资源优化配置为例进行了仿真验证。实验证明，所建立的3层演化模型是有效的。