兔病毒性出血症病毒YM株衣壳蛋白基因的克隆和中国分离株的遗传变异分析

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应用RT—PCR的方法从某兔场病死兔肝脏组织中分离到RHDV,命名YM株。克隆出衣壳蛋白VP60并测序,测序结果显示vP60全长1740bp,编码579个氨基酸。从GenBank下栽包括EBHSV、RCV、RHDV共45条序列,运用生物信息学软件分析,构建系统进化树和氨基酸同源性比较,世界不同地区RHDV分离株氨基酸保守性较高,可达94.1%。99.7%,EBHSV与RHDV氨基酸同源性约为75%,而RCV与RHDV的同源性〉90%。系统进化树分析显示,所选的RHDV可分为两个基因群,一组是包括WX-.8
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