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高校是国家创新系统的重要组成部分,高校的创新能力和效率是国家的重要资源。基于2004―2017年数据,采用BCC模型和灰色关联分析法对我国高校创新效率和影响效率的投入指标进行分析。结果显示:我国高校创新活动规模效率有待提高,投入产出效率的有效单元较少;高校创新效率与科研经费、科研人员的数量、科研投入时间相关度高;创新效率低与创新环境和制度有关。为了提高高校科技创新能力,应增加和合理配置高校科研经费、激发高校科研创新人员的积极性、建立高校科研成果转化机制。