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目的:对大同市2011年手足口病进行病原学调查,了解大同市肠道病毒的感染情况。方法:采用实时荧光定量PCR方法(real-timePCR),对临床诊断为手足口病的118例患者进行肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxA16)的核酸检测。结果:118例患者中,88例EV71、29例CoxA16、1例其他肠道病毒;5、6月份为疫情高峰期。结论:2011年大同市儿童手足口病以EV71为主,CoxA16也有散发病例;应加强对EV71和CoxA16的鉴别诊断。