汉坦病毒Q32株L和M片段全基因序列分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zwj306041732
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目的 测定汉坦病毒Q32株L、M片段的全长序列,了解其分子基础.方法设计特异的PGR引物,用RT-PCR技术分段扩增Q32株全长L、M片段,PCR产物纯化后直接测序,或用T-A克隆方法进行PCR产物克隆,然后进行遗传进化分析.结果Q32株L片段的全基因序列共6533个核苷酸,GC含量为37.38%,AT含量为62.62%,包含一个单一的开放读码框架(ORF),该读码框架从38到6493,由6456个核苷酸组成,编码2151个氨基酸,可以合成相对分子质量为2.46×105的蛋白.M片段全基因序列共3616个核苷酸,GC含量为39.44%,AT含量为60.56%,包含一个单一的开放读码框架(ORF),其读码框架从41到3448,由3408个核苷酸组成,编码1135个氨基酸,可以合成相对分子质量为1.26×105的蛋白.Q32编码的RNA聚合酶也有6个比较保守的区域.结论汉坦病毒Q32株M和L片段具有和其他汉坦病毒糖蛋白和RNA聚合酶相似的核苷酸一级结构,核苷酸序列虽有差异,但在氨基酸水平上的同源性仍很高。

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