【摘 要】
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本试验从苹果(Malus pumila Mill)转录组数据库中挖掘SSR标记,发现其SSR标记类型共有六种,分别为:单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸,其中频率较
【机 构】
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甘肃农业大学园艺学院,兰州,730070
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本试验从苹果(Malus pumila Mill)转录组数据库中挖掘SSR标记,发现其SSR标记类型共有六种,分别为:单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸,其中频率较高的重复类型为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸.从41 890条苹果无冗余转录组序列中共搜索到了1 803条至少含有1个SSR的序列,占转录组的4.30％.高频重复类型为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,其中数量最多的是A/T,其次是AG/CT和GAG/CTC,共占SSRs的98.23％.该试验共设计了20对引物,分别对20份苹果材料进行PCR扩增.结果 显示:20对引物均能扩增出条带,平均扩增条数为2.7.并对供试的20份苹果品种进行了聚类分析,结果与形态学及生物学分类基本一致,证明品种间亲缘关系的远近具有一定的规律,栽培品种与砧木品种的种间亲缘关系较远,而栽培种和砧木品种的种内亲缘关系较近.另外,本研究为杂交育种挑选合适的亲本,杂交育种以及培育作物新品种提供了一定的理论基础.
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