【摘 要】
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提出了一种多序列比对ClustalW算法并行化处理的新方法ParaClustalW,该方法使用桌面网格计算平台作为高性能编程环境和运行平台。分析了多序列比对算法在桌面网格平台上的任
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提出了一种多序列比对ClustalW算法并行化处理的新方法ParaClustalW,该方法使用桌面网格计算平台作为高性能编程环境和运行平台。分析了多序列比对算法在桌面网格平台上的任务划分方式、并行化策略和实现技术。ParaClustalW策略考虑到序列的数目与序列的长度等因素,实现任务划分的均衡性。经实验证明,ParaClustalW方法具有较好的计算速度和加速比,在同等机器配置下,优于当前的一些计算方法,对多序列比对算法的研究具有参考价值。
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