基于生物信息学的乳腺癌miRNA生物标志物的筛选

来源 :广东药科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huai0407
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目的筛选与乳腺癌相关的miRNA生物标志物,为乳腺癌的早期诊断、预后评估以及药物靶点的研究提供参考。方法从TCGA数据库中收集乳腺癌相关基因芯片数据,将肿瘤组织与正常组织样本数据进行对比分析,筛选差异miRNA与mRNA;预测差异miRNA的潜在靶基因并与差异mRNA取交集,进一步对miRNA进行筛选;采用ROC曲线分析对筛选得到的miRNA进行评价。结果筛选得到9个差异miRNA,对肿瘤样本和正常样本分类良好。分别为6个上调miRNA:hsa-miR-141、hsa-miR-182、hsamiR-183、hsa-miR-200a、hsa-miR-200b、hsa-miR-21;3个下调miRNA:hsa-let-7c、hsa-miR-125b-1、hsa-miR-145。结论筛选得到的差异miRNA可作为乳腺癌的生物标志物,可对乳腺癌的发生进行预测。
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