【摘 要】
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目的 通过对TCGA和GEO数据库中口腔鳞状细胞癌(OSCC)的数据挖掘,探讨FOXD1基因的表达及临床意义.方法 从TCGA和GEO数据库中提取FOXD1在OSCC组织及正常组织的表达信息,分析FOXD1表达与临床特征的关系及预后相关性.采用ESTIMATE和CIBERSORT算法,评估FOXD1高表达组和低表达组肿瘤微环境中基质评分、免疫评分和免疫细胞浸润水平的差异.利用基因集富集分析(GSEA)预测FOXD1相关的生物学功能和信号通路.结果 TCGA和GEO数据集分析发现FOXD1表达在OSCC组织
【机 构】
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中国医科大学生命科学学院生物信息学教研室,沈阳 110122
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目的 通过对TCGA和GEO数据库中口腔鳞状细胞癌(OSCC)的数据挖掘,探讨FOXD1基因的表达及临床意义.方法 从TCGA和GEO数据库中提取FOXD1在OSCC组织及正常组织的表达信息,分析FOXD1表达与临床特征的关系及预后相关性.采用ESTIMATE和CIBERSORT算法,评估FOXD1高表达组和低表达组肿瘤微环境中基质评分、免疫评分和免疫细胞浸润水平的差异.利用基因集富集分析(GSEA)预测FOXD1相关的生物学功能和信号通路.结果 TCGA和GEO数据集分析发现FOXD1表达在OSCC组织中显著上调(P<0.001).FOXD1表达与与不良预后相关(P<0.05).FOXD1表达变化影响肿瘤微环境中M1型巨噬细胞,未活化树突状细胞、活化肥大细胞和滤泡辅助性T细胞的水平.结论 FOXD1在OSCC中呈高表达,且与不良预后相关,FOXD1基因可能是原癌基因,因此可作为OSCC诊断和治疗的潜在靶点.
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