玉米核不育基因MS22克隆及其同源基因生物信息学分析

来源 :热带农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangbenny918
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利用水稻ROXY1、ROXY2基因序列,在玉米基因组数据库进行同源检索,发现GRMZM2G442791基因(MS22)序列与ROXY1、ROXY2之间具有较高的相似度(73%~79%).以玉米B73自交系为实验材料克隆MS22启动子区序列;用生物信息学方法对水稻ROXY1、ROXY2及MS22基因核苷酸序列以及蛋白质结构、亲水性和疏水性及进化树等进行分析.结果表明,玉米雄性核不育相关基因MS22编码区长度为480 bp,编码159个氨基酸;ROY1编码区长度为408 bp,编码136个氨基酸;ROXY2编码区长度为420 bp,编码140个氨基酸.通过对蛋白功能结构域进行分析发现,MS22、ROXY1、ROXY2都为谷氧还蛋白家族成员,具有GRX家族基因相似的功能结构域和近似的三级结构.因此推测,MS22可能与ROXY1、ROXY2具有相似的功能,可能参与氧化还原调节、植物胁迫防御,在控制雄性配子发生中起主要调控作用.
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