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应用cDNA末端快速扩增法（RACE），获得我国登革3型病毒株基因组的包括5′和3′端非编码区的扩增片段，经琼脂糖凝胶电泳观察其长度分别为710bp和470bp。序列分析表明，与登革3型病毒菲律宾株（H87株）核苷酸序列同源性＞99％。进化树分析提示，该株病毒属于登革3型病毒Ⅰ亚型。基因组的5′和3′端可能含有较强的二级结构域。