目的 探讨黄芩汤、葛根芩连汤对溃疡性结肠炎（UC）小鼠肠道菌群的调节作用。方法 采用3%葡聚糖硫酸钠（DSS）水溶液自由饮用7天建立UC小鼠模型,同时连续7天灌服不同剂量黄芩汤和葛根芩连汤,通过观察各组小鼠的体质量、疾病活动指数评分（DAI）、结肠长度及组织病理学来评价两种复方对UC小鼠的疗效,采用16S rDNA高通量测序探究黄芩汤、葛根芩连汤对UC小鼠肠道菌群的影响。结果 与模型组比较,黄芩汤中、高剂量组与葛根芩连汤中、高剂量组均显著改善了小鼠结肠组织病理学、体质量、DAI评分、结肠长度。在肠道菌群方面,两种复方均能调节门水平上的拟杆菌门（Bacteroidota）、厚壁杆菌门（Firmicutes）的相对丰度;在属水平上均能降低有害菌大肠杆菌志贺菌属（Escherichia-Shigella）的相对丰度,其中,黄芩汤在增加有益菌乳杆菌属（Lactobacillus）、毛螺菌属NK4A136 （LachnospiraceaeNK4 A136group）、肠杆菌属（Enterorhabdus）的相对丰度上优于葛根芩连汤;葛根芩连汤在增加有益菌布劳特氏菌属（Blautia）、降低有害菌变形菌门（Proteobacteria）的相对丰度上优于黄芩汤。结论 黄芩汤中剂量在改善体质量、DAI评分、结肠长度方面优于葛根芩连汤不同剂量组,且两种复方可能通过调节肠道菌群平衡从而减轻DSS诱导的UC,其中,黄芩汤在调节有益菌的数目上优于葛根芩连汤。