目的:探索左归丸调控绝经后骨质疏松症的基因共表达靶点。方法:72只雌性大鼠,随机分为假手术组、模型组、雌激素组和左归丸组,每组18只,除假手术组外,其余均摘除双侧卵巢。术后每组又随机分为4、8和12周三个小组,每小组6只大鼠。术后第14天起雌激素组和左归丸组分别以戊酸雌二醇和左归丸灌胃,剂量分别为0.1mg/kg和5g/kg,假手术组和模型组以生理盐水灌胃,连续至手术后第4、8和12周末。第12周末取大鼠第4~6腰椎及单侧股骨、胫骨行骨密度测定以验证模型成功与否并评价中西药疗效。第4、8和12周末分离股骨和胫骨,全骨髓贴壁法培养并纯化骨髓间充质干细胞。Trizol提取细胞总RNA并制备表达谱芯片。SPSS18.0软件筛选三个时间点模型组-假手术组、雌激素组-模型组和左归丸组-模型组比较之差异基因(阈值:P<0.05,差异倍数>2或<0.5),整合差异基因,通过Pearson相关性检验获得共表达基因(阈值:P≥0.8),运用Cyto Scape软件分析并构建基因共表达网络。结果:在模型组-假手术组、雌激素组-模型组和左归丸组-模型组中,分别有328、79和700对基因共表达,构成网络体系。结论:左归丸-模型组中,4个子网络响应治疗过程,K-core子网络可能是左归丸防治绝经后骨质疏松症的直接靶基因模块。