基于特征片段信息的PH domain—like barrel蛋白质折叠类型分类方法

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蛋白质折叠类型分类是蛋白质分类研究的重要内容。以SCOP数据库中的PHdomain—likebarrel折叠类型为研究对象,选择序列相似度小于25%的61个样本为检验集,通过结构特征分析,确定了该折叠类型的模板及其对应的特征参数,利用模板与待测蛋白的空间结构比对信息,提出了一个新的折叠类型打分函数Fscore,建立了基于Fscore的蛋白质折叠类型分类方法并用于该折叠类型的分类。用此方法对Astrall.75中序列相似度小于95%的16711个样本进行检验,分类结果的特异性为99.97%。结果表明:特征参
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