【摘 要】
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通过Illumina MiS eq高通量测序技术,对花生根、茎、叶、花不同器官内生细菌16S r RNA的V5~V7可变区进行测序,研究花生内生细菌群落多样性。从花生不同器官内一共获得61 396条
【机 构】
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河南省科学院生物研究所有限责任公司/河南省微生物工程重点实验室;
【基金项目】
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河南省科学院基本科研业务费项目(210605008);河南省科学院杰青人才培养项目(200405006);河南省科学院助推科技成果转化项目(210205029);国家自然科学基金项目(31800361)
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通过Illumina MiS eq高通量测序技术,对花生根、茎、叶、花不同器官内生细菌16S r RNA的V5~V7可变区进行测序,研究花生内生细菌群落多样性。从花生不同器官内一共获得61 396条有效序列和468个OTU(Operational Taxonomic Units)。物种分类显示花生内生细菌种类隶属于21个门、43个纲、107个目、177个科和284个属。根部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和魏斯氏菌属(Weissella),相对丰度分别为37.67%、25.13%和7.38%;茎部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为73.12%和8.88%;叶部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas)和红球菌属(Rhodococcus),相对丰度分别为78.65%和8.55%;花部内生细菌优势属为假单胞菌属(Pseudomonas),相对丰度为15.15%。PICRUSt功能预测表明,叶部内生细菌中参与调控各种代谢通路的物种丰度最高,茎部和根部次之,花部最低。以上研究结果表明花生内生细菌具有丰富的种群多样性,为今后开发利用花生内生细菌资源奠定了基础。
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