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通过分析1998—2011年我国地方政府R＆D经费投入数据，本文勾画了地方政府R＆D经费投入的时空变化与演进逻辑。从总量看，投入排名前列的基本上是北京、上海等东部发达地区，而排名后置的基本上是中西部地区；从投入力度和增量看，地区间差异也基本如此，且人均R＆D经费投入地区间差距不断扩大；地方政府“十二五”科技发展规划R＆D经费投入目标设置过高，实现难度大。建设创新型国家，实现跨越式发展，除加大特别是对中西部地区的科技投入，还需加强区域间科技横向合作，降低科技创新风险，制定合宜的“十二五”科技发展规划。