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选取珠江口上游到下游的四个站点采用16SrRNA-DGGE方法分析了珠江口表层沉积物中微生物群落结构。结果表明：四个站点中微生物组成差别较大，并且珠江口上游的微生物多样性稍低于下游。基于萘双加氧酶基因（ndo基因）的DGGE分析则表明珠江口上游和下游区域中的ndo基因多样性（站点A1和A4）高于珠江口中游（站点A2和A3）。为了进一步探讨环境因子与ndo基因分布的相关关系，典型对应分析（canonical correspondence analysis，CCA）发现站点A1中ndo基因组成主要受NH4-N