本研究的目的是调查、建立细菌痢疾、霍乱和伤寒等DNA基因型库，为控制细菌痢疾、霍乱和伤寒等重点肠道传染病提供科学依据。研究方法为收集湖北省2000～2010年细菌痢疾、霍乱和伤寒等疫情资料，分析湖北省细菌痢疾、霍乱和伤寒等的流行强度和三间分布。制定主要仪器的标准使用方法，编制痢疾、霍乱和伤寒等重点肠道细菌的鉴定和基因分型实验方法。用脉冲场凝胶电泳检测痢疾杆菌，霍乱和伤寒菌基因，用BioNumerics V4.0软件分析基因型。调查结果为，1996～2005年间共发生细菌痢疾、霍乱和伤寒等暴发疫情15起，分布在6个市州1个省直管市10个县（市）区内，调查病例1744例，死亡5例。近十年检测8株宋内志贺氏菌中鄂西南、鄂西北的宋内志贺氏DNA基因型相近，江汉平原和鄂东北等地区宋内志贺氏DNA基因型相近；检测29株福氏志贺氏菌DNA基因型，来源鄂西南、鄂西北地区DNA基因型相近，江汉平原和部分鄂东北等地区DNA基因型相近，湖北省内志贺氏菌基因型分布相对复杂。分别来自西北和东南地区的5株霍乱基因型相近。伤寒来自2个地区，其基因型一致。结论为，建立了细菌痢疾、霍乱和伤寒等DNA基因型分析方法，通过了细菌分子分型网络实验室的认可，确定不同病人发生地的细菌痢疾、霍乱和伤寒杆菌等重点肠道细菌的同源性，可以有效追踪传染源。