【摘 要】
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根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从火龙果基因组中扩增出260bp左右的目标条带,经回收、克隆、测序及序列分析,获得了23条来源于火龙
【机 构】
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贵州大学贵州省农业生物工程重点实验室,
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根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从火龙果基因组中扩增出260bp左右的目标条带,经回收、克隆、测序及序列分析,获得了23条来源于火龙果试管苗变异和非变异材料的反转录酶序列。通过系统演化分析,所得序列可分为5类,存在较高的异质性;与母株相比,变异植株的反转录酶序列存在缺失、移码和终止密码子突变。经反转录酶氨基酸序列对比,火龙果与其它物种间具有较高的同源性,表明在不同物种间可能存在反转录转座子的横向传递作用。
The degenerate primers were designed according to the conserved region of Ty1-copia retrotransposon reverse transcriptase. The target region of 260bp was amplified from the genome of dragon fruit by PCR amplification. After recovery, cloning and sequencing, Sequence analysis showed that 23 reverse transcriptase sequences were obtained from mutant and non-mutagenic plants of pitaya plants. Through phylogenetic analysis, the obtained sequences can be divided into five categories, which have high heterogeneity. Compared with the parental plants, the reverse transcriptase sequences of the mutants have the deletion, frameshift and stop codon mutations. The reverse transcriptase amino acid sequence comparison, dragon fruit and other species have a high homology, suggesting that there may be cross-transposon transmissome among different species of horizontal transmission.
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