农业生态系统极易遭受外来生物入侵。作者根据文献资料和多年工作观察统计出入侵我国农业生态系统的外来生物共计92科175属239种,其中植物155种,动物55种,微生物29种,植物多为有意引入后逸生,而动物和微生物则主要是无意引入。外来入侵种发生数量呈现从南到北、从东到西逐渐减少的趋势。这些入侵种中,来源于美洲的最多(占45.04%),其次是欧洲(22.90%);菜地(包括温室大棚)和果园入侵种最多,分别达64.85%和66.53%,而半年期的秋熟旱地和夏熟旱地分别占34.31%和23.85%。其中17种外来杂草、10种害虫、7种病原菌为恶性有害生物,应作为防除的重点目标。目前农业生态系统外来入侵物种的控制以化学防治为主,但由于长期施用化学农药,在侵入我国农田的入侵种中,已有51种在世界不同地区演化出抗药性生物型,因而需重视生物防治、农业和生态防治以及检疫等的综合应用。今后外来种对农业生态系统的入侵格局、机制和趋势,入侵途径以及生物入侵和抗药性生物型对农业生态系统中有害生物群落演替的影响、转基因作物导致的生物入侵等问题值得关注。