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层序及其边界的形成主要控制因素为:构造沉降作用;相对海(湖)平面周期性升降;沉积物供给量;古气候。层序是这四者之间相互作用的结果。构造作用和海平面是控制层序形成和演化的关键;相对海平面周期性升降直接控制着可容纳空间的变化速率;沉积物类型、物源特征及沉积环境等还直接控制着沉积体系的发育;气候因素对层序形成的控制作用主要体现在对沉积物类型的控制。