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源自2004年的日本国立大学法人化改革，通过变更机构与人员性质、改变管理模式和财务制度等一系列重大的举措而一直受到世人的关注。实施改革六年多来，日本国立大学法人在教育教学、科学研究和社会服务以及学校运营等诸多方面均发生了显著的变化，所有学校均较好地完成了当初制定的目标，其中不少大学更是成绩优良，可以认为改革在第一阶段获得了成功，与此同时也存在着法人化改革对学术自由有一定影响等问题。