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目的：检测在冬虫夏草僵虫体、子座和子囊果部位多菌共存和差异表达导致的随机扩增多态性DNA（random amplified polymorphic DNA,RAPD）分子标记多态性及其在冬虫夏草成熟过程中的动态变化.方法：采用模糊、整体性RAPD分子标记多态性研究法,选用20条随机引物,应用ZUNIX丰度加权相似度公式和丰度加权聚类法,比对冬虫夏草3个成熟期僵虫体、子座和子囊果部位RAPD分子标记多态性,以及与中国被毛孢的差异.结果：丰度非加权算法忽略了RAPD共有扩增子的丰度差异,而丰度加权ZUNIX相