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为明了O型口蹄疫病毒基因组的结构特征及其变异与结构、功能的关系，以及系统发生关系，利用DNAStar程序进行了0型口蹄疫病毒基因组序列同源性分析、多重排比。结果表明，O型口蹄疫毒株（O／CHA／99）基因组ORF大小为6999nt，编码2332个氨基酸（aa）的多聚蛋白；口蹄疫病毒RNA的保守性、变异性及其遗传变异，对理解0型口蹄疫病毒的感染、宿主范围和传播有重要作用。