[木奈]褐变果实均一化全长cDNA文库的构建及部分ESTs序列分析

来源 :热带作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangmeiqing
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以发生褐变初期的木奈果肉总RNA为材料。对SMART^TM cDNA合成方法进行改良。并将长距离PCR、DSN处理和定向克隆相结合,成功构建木奈褐变果实均一化全长eDNA文库。经检测,该文库的初始滴度为2.0x106pfu/mL,重组率为99%,插入片段大小平均为1.8kb,文库质量良好。随机挑取720个阳性克隆进行5’EST测序,共获得684条有效的ESTs序列;并将684条有效序列拼接后,58条被组装成21个重叠群(eontigs),单拷贝(singlets)基因有626条,共得到647个单基因簇(u
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