【摘 要】
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非编码序列,特别是内含子的起源,是一个重要的悬而未决的问题.首先通过计算模式生物的编码序列和非编码序列的不同阅读框中3-tuple的频率分布,发现编码区中不同阅读框具有十
【机 构】
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北京大学蛋白质工程与植物基因工程国家重点实验室,北京大学数学科学学院,中国科学院遗传与发育生物学研究所,北京大学蛋白质工程与植物基因工程国家重点实验室
【基金项目】
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科技部科研项目，国家自然科学基金
论文部分内容阅读
非编码序列,特别是内含子的起源,是一个重要的悬而未决的问题.首先通过计算模式生物的编码序列和非编码序列的不同阅读框中3-tuple的频率分布,发现编码区中不同阅读框具有十分不同的3-tuple分布,而在非编码区中,不同阅读框的3-tuple分布几乎相等,并且这一性质不具有物种依赖性.为了描述分布差异的程度,引进度量-对称相对熵,并通过比较原核生物和真核生物,发现无论是编码区还是非编码区,原核生物都具有比真核生物更高的SRE值.进一步研究表明,某一生物的SRE值与该生物全基因组中编码区所占的百分比存在一定.
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