论文部分内容阅读
目的 使用生物信息学分析溶质载体家族6成员6（SLC6A6）表达在胶质母细胞瘤（glioblastoma, GBM）发生发展中的作用及潜在机制。方法 中国脑胶质瘤基因组图谱计划（CGGA,http://www.cgga.org.cn/）及美国癌症基因组图谱计划（TCGA,http://www.cancergenome.nih.gov/）数据库中分别获取胶质瘤和GBM中SLC6A6基因mRNA表达谱、患者临床病理信息及生存预后信息。运用Kaplan-Meier生存曲线及单因素Cox比例回归风险模型分析SLC6A6表达水平与脑胶质瘤患者生存预后的关系。利用生物信息学（DAVID、GO和KEGG）分析SLC6A6基因参与的生物学功能及信号通路调控。结果 在CGGA数据库中，SLC6A6基因表达水平与胶质瘤病理分级（P=0.024）和IDH突变（P=0.042）显著相关，其中，SLC6A6表达水平在GBM中表达较胶质瘤Ⅰ～Ⅲ级组织中显著升高（P＜0.001）,但在IDH突变型胶质瘤组织中表达显著降低（P＜0.001）;SLC6A6高表达组中位总生存时间较低表达组显著缩短（P＜0.001）。在TCGA数据库中，GBM SLC6A6高表达组总生存时间及无疾病进展期均较低，表达组显著缩短（分别P=0.005,P=0.016）。生物信息学分析提示，SLC6A6可能参与细胞因子受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、细胞黏附、ECM-受体相互作用和肿瘤坏死因子等信号通路调控GBM的恶性生物学行为。结论 SLC6A6表达与胶质瘤病理分级、IDH突变及患者不良预后有关，SLC6A6可能是GBM发生发展潜在的生物标志物和治疗靶标。