物流业是当代推进区域经济发展的新的经济增长点,现代物流业是新疆作为"中亚地区商贸中心"国家战略的基础产业,新疆北疆地区是"发展现代化大产业、支撑新疆经济重任"的战略高地,研究北疆地区的现代物流业效率问题对协调发展新疆现代物流业具有一定的指导和借鉴意义。本文运用DEA分析法的C2R模型和C2GS2模型对北疆8个地区2006-2012年的物流效率进行分析。结果表明,北疆地区物流效率水平较低,8个地区中乌鲁木齐市和克拉玛依市物流DEA有效,石河子市、昌吉州、塔城地区、博州、伊犁州和阿勒泰地区物流DEA非有效。物流DEA非有效的地区间物流效率差异比较大,主要是纯技术效率非有效引起的,也就是物流业投入、产出结构不合理,物流投入资源没有转化为有效的物流产出。对区域物流效率的影响因素进行分析,公共环境和社会保障投资及物流业产值表现出对区域物流效率较强的影响力。最后,针对北疆地区物流效率表现出的不足提出相应的对策建议。