香菇EST资源的SSR信息分析

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对来源于NCBI公共数据库的12144条香菇(Lentinus edodes)EST序列进行简单重复序列SSR搜索。结果表明:在这些香菇EST序列中共有359个SSR位点,46种SSR的重复单元,其中2碱基重复243条(67.69%),3碱基重复114条(31.76%),5碱基重复1条(0.28%),6碱基重复1条(0.28%)。平均33.8条EST序列中有1个SSR。SSR的碱基总数达7727kb,约占整个EST序列碱基数的2.94%。本实验还根据搜索结果设计了100条香菇EST-SSR引物,并随机合成
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