【摘 要】
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人体微生物成分和功能变化对其表型或疾病有着重要的影响,在研究微生物对人体影响时不能仅仅考虑单个微生物动态,还应考虑分类水平下群落的整体影响。为此,提出一种基于tree-
【基金项目】
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国家自然科学基金(31301092)
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人体微生物成分和功能变化对其表型或疾病有着重要的影响,在研究微生物对人体影响时不能仅仅考虑单个微生物动态,还应考虑分类水平下群落的整体影响。为此,提出一种基于tree-based LASSO的微生物组子结构回归分析方法,以分析微生物群落与人体表型之间的关联影响。首先,结合系统发育树结构,构建一种新的惩罚函数逐节点分析树结构;其次,对148个样本进行复杂和稀疏子结构回归对比实验及系数评估,对位于不同子结构上菌种的回归系数进行结果对比分析,并与传统LASSO方法进行比较。结果表明,该方法能够突出微生物群落树结
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