“肺肠合治法”理论起源可追溯至《黄帝内经》，阐释了肺与大肠在生理和病理上的相互影响。近年来，研究者从多方面研究并探讨“肺肠轴”理论的科学实质，相关理论基础不断完善，并将其应用于新冠肺炎，急性肺损伤等肺部疾病。肺与肠在多方面联系密切，体现了中医学的整体观念，阐释了脏器之间相互关联的整体论，在生理上相互联系，病理上也相互影响。肠道微生态失调可以影响肺的免疫功能引起呼吸道疾病，而呼吸道疾病也通常伴有胃肠道症状，通过调控肠道菌群可以防治肺部疾病。根据组织胚胎学，肺肠上皮组织均来源于原始前肠，在免疫学中，肺与肠均含有粘膜相关淋巴组织，呼吸道的病理变化亦与肠道微生物密切相关，这种肺与大肠的组织来源一体性、黏膜免疫相关性、生态变化同步性，为“肺肠合治法”提供了客观化的科学依据。故此文就“肺肠合治”理论渊源，现代研究机制及其临床运用的研究概况进行综述，以期为“肺肠合治法”思想在临床和科研上的应用提供新的方向。