基于氨基酸亲疏水分布的最小离散增量方法识别蛋白质超家族

来源 :内蒙古大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shijiuliangaijujun
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摆脱目前常用的基于特征模体来识别超家族的方法.引入单个氨基酸的物理化学性质(亲疏水性质)及其在氨基酸序列中的分布特征参数(分段的方法),利用最小离散增量算法对属于同一结构类的不同超家族进行了识别,总预测成功率令人满意.选取了全α类、全β类、α+β类、α/β类中的各4个超家族分别进行了识别.对全α类的4个超家族,self-consistency检验和jack-knife检验可达83.0%,81.2%,对全β类的4个超家族,两种检验均为80.9%,对α+β类的4个超家族,两种检验总成功率最高分别为88.6%,
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