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在新常态背景下，高校应根据行政事业单位科研经费内部控制规范，对所有经费实施严格管理，确保高校科研经费的合理运用。强化高校科研经费管理不仅具有现实意义，而且对于规范高校科研经费管理有参考价值。高校科研经费管理难点主要表现在：科研、财务管理部门监管失效；科研经费管理方式落后，存在制度缺陷；科研经费的预算编制不完善；资源配置不合理，利用率较低等方面。新常态下转变高校科研经费管理模式的对策：严格执行科研经费管理制度；对经费的预算编制进行完善；建立信息化科研经费管理平台；加强人员培训，提升管理意识。