利用建兰转录数据开发genic-SSR标记

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gr123abc
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建兰(Cymbidium ensifolium)因基因组信息缺乏导致其分子标记的开发和利用受到一定限制。为了开发可靠、有效的分子标记,本研究对建兰转录组进行了大规模测序,并对此数据进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)搜索。根据基元、长度和所在位置选取80对genic—SSR进行引物设计;在12个建兰品种中进行扩增验证,结果发现,61对引物成功扩增,其中39对引物有多态性,其多态信息含量(polymorphism information content,PIC)范围为0.
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