人参具有极高的药用价值,除野生人参外,虽已在河南、湖北等地区均已实现人工栽培,但仍难以满足需求。多数研究显示,人参内生菌可能是解决人参供不需求较为行之有效的方案;但关于野生与栽培人参内生细菌差异的研究较少。采用宏基因组测序技术分析野生及栽培型人参内生细菌种类及多样性。结果显示,2种不同来源的人参内生细菌主要包括3个门:变形菌门(Proteobacteria)、硬壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria),其中变形菌门占据主导地位。在变形菌门中,野生人参内生细菌中γ-变形菌纲为第一大纲,栽培人参内生细菌中芽孢杆菌纲(Bacilli)为第一大纲。野生人参内生细菌多集中于类芽孢杆菌科(Paenibacillaceae)、假单胞菌科(Pseudomonadaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)等;栽培人参内生细菌多集中于类芽孢杆菌科(Paenibacillaceae)、动性球菌科(Planococcaceae)、假单胞杆菌科(Pseudomonadaceae)等。这些数据显示,不同产地的人参内生细菌多样性略有差异。研究结果为进一步探讨人参内生细菌次生代谢产物、不同产地间人参内生细菌差异性等提供理论基础和技术支撑。