【摘 要】
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目的检测我国镇江地区2008年手足口病（HFMD）散发病例中的肠道病毒71型（EV71）,并进行毒株的种系进化分析。方法采集临床HFMD患者粪便标本,抽提病毒RNA,通过巢式聚合酶链反应技术进
【基金项目】
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基金项目：江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目（苏教高（2008）34号）,江苏大学创新训练计划（2009-136）江苏大学“拔尖人才工程”项目（致谢：感谢江苏大学基础医学与医学技术学院苏兆亮老师在数据的进化分析方面给予的帮助.）
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目的检测我国镇江地区2008年手足口病（HFMD）散发病例中的肠道病毒71型（EV71）,并进行毒株的种系进化分析。方法采集临床HFMD患者粪便标本,抽提病毒RNA,通过巢式聚合酶链反应技术进行特异性扩增。经琼脂糖凝胶电泳鉴定为阳性的标本,采用EV71特异性引物对其VP1区的核苷酸序列进行扩增。扩增的VP1片段经纯化后与测序载体PET32a（＋）连接,转化大肠埃希菌DH5α,并对阳性质粒进行酶切和测序鉴定。利用Clustalx和MEGA4.0分析软件,进行系统进化分析。结果通过聚合酶链反应扩增获得EV71
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