甜瓜ADF7基因的克隆与生物信息学分析

来源 :沈阳农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：good240

【摘要】

：

肌动蛋白解聚因子(actin-depolymerizing factors,ADFs)通过剪切和解聚微丝来调控微丝组织和动态,被认为是肌动蛋白变化的重要调控因子。通过RT-PCR方法扩增得到甜瓜ADF7(CmA

【作者】

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吕艳玲何明张家旺张丽丽刘石磊闫大波汪澈

【机构】

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辽宁省农业科学院蔬菜研究所,沈阳农业大学生物科学技术学院

【出处】

：

沈阳农业大学学报

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

肌动蛋白解聚因子 CmADF7 甜瓜克隆生物信息学分析 actin depolymerizing factorCmADF7melonclonebioinfo

【基金项目】

：

国家重点研发计划项目(2018YFD0201309),国家自然科学基金项目(31970183),国家西甜瓜产业技术体系沈阳综合试验站项目(CARS-25),辽宁省教育厅项目(2019-2021),辽宁省“百千万人才工程”项目(2019-2021),辽宁省农业科学院院长基金项目(2020QN2403)

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肌动蛋白解聚因子(actin-depolymerizing factors,ADFs)通过剪切和解聚微丝来调控微丝组织和动态,被认为是肌动蛋白变化的重要调控因子。通过RT-PCR方法扩增得到甜瓜ADF7(CmADF7)基因序列,进行生物信息学分析和组织表达分析。结果表明CmADF7基因的开放阅读框(ORF)为414 bp,编码137个氨基酸,蛋白质理论分子量15.82102 kD,等电点5.32。生物信息学预测该蛋白是不具有跨膜结构的疏水性蛋白,亚细胞定位于细胞质中。基因结构分析显示CmADF7包含3个外

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