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六棵树金矿位于新疆奇台县境内,大地构造位置位于北准噶尔弧盆带,卡拉麦里晚古生代弧后盆地,区域地层出露非常丰富,松喀尔苏组以及姜巴斯套组（下石炭统）地层在该区广泛出露,卡拉麦里组以及北塔山组（中泥盆统）与库布苏上下压群（志留系）也广泛发育,还有侏罗纪以及双井子组和白垩纪等。金含矿层位为下石炭统姜巴斯套组上下亚组。区内断裂和褶皱构造发育,岩浆活动频繁,初步判断该矿成因为浅成中温热液玢岩脉型金矿。现就其地质特征及矿床成因分述如下。