【摘 要】
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目的 了解云南省部分地区奶牛芽囊原虫感染情况及其基因亚型,为该病的防控提供数据支持.方法 于2019年6月-2020年8月从昆明、大理、保山地区采集荷斯坦奶牛和奶水牛粪样,提取粪样DNA,巢式PCR扩增芽囊原虫小亚基(SSU) rRNA基因,测序后在NCBI上进行BLAST比对,用MEGA 6.0软件以邻接法构建系统进化树.采用SPSS 20.0与SAS 9.1软件对不同地区、季节、养殖方式、品种、性别和发育阶段奶牛感染率进行统计分析,对差异有统计学意义的因素进行二元logistic回归分析.结果 共采集
【机 构】
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云南农业大学动物医学院,昆明650201;云南省宾川县畜禽良种推广站,宾川671600;云南农业大学动物科学技术学院,昆明650201;云南农业大学动物医学院,昆明650201;云南农业大学动物科学技
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目的 了解云南省部分地区奶牛芽囊原虫感染情况及其基因亚型,为该病的防控提供数据支持.方法 于2019年6月-2020年8月从昆明、大理、保山地区采集荷斯坦奶牛和奶水牛粪样,提取粪样DNA,巢式PCR扩增芽囊原虫小亚基(SSU) rRNA基因,测序后在NCBI上进行BLAST比对,用MEGA 6.0软件以邻接法构建系统进化树.采用SPSS 20.0与SAS 9.1软件对不同地区、季节、养殖方式、品种、性别和发育阶段奶牛感染率进行统计分析,对差异有统计学意义的因素进行二元logistic回归分析.结果 共采集奶牛粪样841份,其中65份SSU rRNA基因扩增阳性,扩增片段长1100 bp.奶牛芽囊原虫总感染率为7.7％ (65/841,95％CI:5.92％～9.53％),其中,昆明、保山、大理地区的感染率分别为12.9％(32/248,95％CI:8.73％～17.08％)、8.1％ (19/236,95％CI:4.58％～11.52％)和3.9％ (14/357,95％CI:1.91％～5.94％),不同地区之间感染率差异有统计学意义(x2=16.601,P＜0.01);夏、秋、冬季的感染率分别为9.4％(56/599,95％ CI:7.86％～37.30％)、8.3％ (8/96,95％CI:2.80％～13.86％)和0.7％(1/146,95％CI:0～2.02％),不同季节之间感染率差异有统计学意义(x2=12.411,P＜0.05);圈养、放养的感染率分别为8.3％ (58/702,95％CI:6.23％～10.30％)、5.0％(7/139,95％CI:1.40％～8.67％),二者差异无统计学意义(x2=1.693,P＞0.05);荷斯坦奶牛、奶水牛的感染率分别为8.4％ (41/490,95％CI:5.92％～10.82％)、6.8％ (24/351,95％CI:4.20％～9.48％),二者差异无统计学意义(x2=0.671,P＞0.05);公牛、母牛的感染率分别为11.1％(10/90,95％CI:4.62％～17.60％)、7.3％ (55/751,95％CI:5.46％～9.19％),二者差异无统计学意义(x2=1.617,P＞ 0.05);断奶前犊牛、断奶后犊牛、育成牛、成年牛的感染率分别为2/18 (95％CI:0～25.63％)、26.2％ (11/42,95％CI:12.89％～39.49％)、15.1％ (11/73,95％CI:6.86％～23.28％)、5.8％ (41/708,95％CI:4.07％～7.51％),不同阶段间感染率差异有统计学意义(x2=29.604,P＜ 0.01).二元logistic回归分析结果显示,季节(P＜0.05)和发育阶段(P＜0.01)是奶牛感染芽囊原虫的独立影响因素.序列比对分析结果显示,1份粪样的SSU rRNA基因序列与GenBank登录号KX618192(ST3亚型)的序列一致性为96.3％,35份与MH104059、KC148207、MH358363(ST10亚型)的序列一致性为97.3％～～99.7％,23份与MT453998、MT453999(ST12亚型)的序列一致性为98.7％～～ 100％,6份与MH358361、MH358362、KC148205、KC148206(ST14亚型)的序列一致性为98.7％～100％.系统进化树分析结果显示,本研究中的芽囊原虫分别汇聚在ST3、ST10、ST12和ST14亚型分支上,各亚型的构成比分别为1.5％(1/65)、53.9％ (35/65)、35.4％ (23/65)和9.2％ (6/65).结论 云南省奶牛存在芽囊原虫感染,ST3和ST12基因亚型具有人兽共患风险,应该加强对该病原体的防控.
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