【摘 要】
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探针集的挑选是寡核苷酸芯片设计过程中最重要的部分。基于合成探针成本的考虑，探针的个数成为评价探针集优劣的一个最重要的指标。一个好的探针挑选算法应该挑选出尽可能少的
【机 构】
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景德镇陶瓷学院信息工程学院,清华大学生物科学与技术系
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(60961003)
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探针集的挑选是寡核苷酸芯片设计过程中最重要的部分。基于合成探针成本的考虑，探针的个数成为评价探针集优劣的一个最重要的指标。一个好的探针挑选算法应该挑选出尽可能少的探针。为此，对探针选取的贪心算法作了改进，提出一个类似于逐步向前回归算法的探针选取算法。该算法在每次向探针集加入边际效用最大的探针的同时，把边际效用没有或者很小的探针从探针集中剔除出去。对HLA等位基因数据的实验结果表明，逐步选取算法得到的探针集优于贪心算法挑选出的探针集。
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